В моем понимании меню второго уровня это навигационное меню пункты которого являются дочерними по отношению к пунктам некоторого главного меню.
В Joomla как и в большинстве других cms такие меню бывают разных типов, но все реализуются встроенными средствами (функционалом) движка.
Я ранее описывал создание следующих типов меню второго уровня (с помощью имеющегося модуля mod_mainmenu):
1. DropLine меню.
2. SplitMenu (Сплит-меню).

Если у вас есть чем дополнить мой ответ — добро пожаловать в обсуждение в комментариях.